長崎港は1571年（元亀２年）にポルトガル船が入港して以来、貿易港として栄えてきました。幕末の1858年（安政５年）に安政の通商諸条約が締結され、翌年に米・英・仏・露・蘭との貿易のために長崎、神奈川、箱館（函館）の３港が開港されたことから、1863年（文久３年）長崎港に外国貿易に関する徴税などを行う運上所が設置され、これが税関のはじまりとなりました。
　そして1873年（明治６年）に「長崎運上所」も「長崎税関」と改められ、現在も全国に設置されている９税関のひとつとして長崎県（壱岐、対馬を除く）のみならず九州西岸を管轄しています。
　税関では秩序正しい貿易を守り、社会や経済を乱す不正な輸出入を取り締まる役割を担い、安全・安心な社会の確保（薬物・銃器などの水際阻止）、関税等の適正・公平な課税、貿易の円滑化を３つの使命として業務が行われています。
　資料展示室では、長崎税関の歴史や税関業務が紹介され、あわせてけん銃・麻薬などの密輸の手口、知的財産侵害物品（コピー商品）、ワシントン条約該当物品などが展示されています。
　詳しくは長崎税関のＨＰ（http://www.customs.go.jp/nagasaki/mizugiwa/tenjisitu.html）をご覧ください。